其中，有三个系统为核心子系统：
一、医院集中供水系统
医院集中供水系统主要包括医用纯水集中供应系统和酸性氧化电位水集中供应系统，基本涵盖了一个综合性医院的所有医疗用水种类。
二、 医院中水利用系统
医院中水利用系统主要包括雨水收集与处理系统和中水处理系统，可以有效提高医院的综合水资源利用率，节省大量资源。

三、医院污水深度处理系统
医疗污水处理系统，主要采用两种处理工艺，传统处理工艺和MBR深度处理工艺，处理范围涵盖了医疗机构门诊、病房、手术室、各类检验室、病理解剖室、放射室、洗衣房、太平间等处排出的诊疗、生活及粪便污水及与上述污水混合排出时的医疗机构其他污水。

医院集中供水系统设计需遵循五大设计原则：
1、先进性：采用国际或国内通行的先进技术。
2、成熟性：以适用为原则，采用成熟的或经过工程检验的先进技术。
3、标准化：采用标准化的设计和标准化的产品。
4、安全性：包括系统自身安全和信息传递的安全。
5、设计使用寿命：提供全新的和质量一流的的材料及设备，并设计成长期使用寿命期，适用于每天连续工作24小时。
在此五大原则的基础上，通过以膜分离为技术核心的处理工艺“预处理系统->反渗透系统->后处理系统->循环输配系统”，实现“集中制水，分质供水”，达到如下要求：
1、能耗低，运行费用低。
2、设备选型合理、可靠、先进、高效节能，最大可能地减少投资费用、维修费用。
3、运行安全，系统考虑应急处理措施，异常情况下保证一定时间的供水及重点科室供水。
4、充分考虑浓水综合利用，提高水资源利用率。
5、提供的材料及设备是全新的和质量一流的，并设计成长期使用寿命期，适用于每天连续工作24小时。
6、系统设备易于检验、清洗、润滑及维修。
医疗污水处理系统设计需遵循六大设计原则：
1、全过程控制原则：对医院污水产生、处理、排放的全过程进行控制。

2、减量化原则：严格医院内部卫生管理体系，在污水和污物发生源处进行严格控制和分离，医院内生活污水与病区污水分别收集，即源头控制，清污分流。

3、就地处理原则：为防止医院污水输送过程中的污染与危害，在医院必须就地处理。

4、分类指导原则：根据医院污水性质、规模、排放去向和地区差异，对医院污水处理进行分类指导。

5、达标与风险控制相结合原则：全面考虑综合性医院和传染病医院达标排放的基本要求，同时加强风险控制意识，从工艺技术、工程建设和监督管理等方面提升应对突发性时间的处理能力。

6、生态安全原则：有效去除污水中有毒有害物质，减少消毒过程中消毒副产物产生和控制出水中过高余氯，保护生态环境安全。

7、在此六大基础原则的基础上，通过传统处理工艺和MBR深度处理工艺，是医疗污水能达到《医疗机构水污染物排放标准》GB 18466-2005的排放标准。